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環境科學與工程系成立于1997年，現設有環境科學與工程教研室，全系共有教師6人，其中教授1人，副教授3人，講師2人。

我校的環境科學與工程學科是在國土資源部“環境地質”重點學科的基礎上，依托“地質災害防治與地質環境保護國家重點實驗室”，由原成都地質學院水文地質專業（部分）發展演化而來。經過十多年的發展，該學科擁有學士、碩士、博士三級學位授予權，涵蓋市政工程、地下水科學與工程兩個博士點，環境科學、環境工程、市政工程、地下水科學與工程等四個碩士點，擁有環境工程一個工程碩士招生領域。其中，環境工程為四川省級重點學科。

環境科學與工程系下設環境工程一個本科專業，現有在校本科生130余人。該專業緊密結合西部環境特點和西部開發需要，發揮我校傳統地學優勢，深入學習環境科學與工程的理論與技術，在高難度廢水處理技術、地下水污染控制、環境規劃與影響評價、環境分析與檢測技術等方面具有特色。學生畢業后掌握環境工程、環境科學方面的基礎和專業理論知識，能在國家機關、環保機構、企事業、科研院所和高等院校等單位從事水、氣、聲、固體廢物等污染防治、環境監測與管理、地下水與污染場地修復、環境規劃和影響評價等方面的研究、開發、設計、工程建設、科研和教學等工作，也可以繼續攻讀環境科學與工程及其它相關專業的碩士、博士。

主要課程：環境分析與監測、環境工程生物學、環境化學、污水與廢水處理、固體廢物處理與處置、大氣污染控制工程、地下水污染控制、場地污染修復技術、環境評價與規劃、環境工程設計。