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復旦大學稅務碩士專業學位旨在適應我國現代稅務事業發展對稅務專門人才的迫切需求，面向稅務機關、企業、中介機構及司法部門等相關職業，培養具備良好的政治思想素質和職業道德素養，系統掌握稅收理論與政策、稅收制度、稅務管理以及相關領域的知識和技能，充分了解稅務稽查、稅務籌劃以及稅務代理等高級稅收實務并熟練掌握其分析方法與操作技能，具有解決實際涉稅問題能力的高層次、應用型專門人才。現有企業稅務和稅務管理兩個研究方向，學制二年。

開設稅收理論與政策、中國稅制專題、國際稅收專題、稅務管理專題、稅務籌劃專題、財務報表分析、公共管理、數量分析方法等專業必修課和選修課，特別注重通過案例分析、模擬訓練等多種方式培養學生解決實際問題的能力，注重與注冊會計師、注冊稅務師等相關從業資格考試的銜接。學生修滿規定的36個學分、完成專業實習并通過學位論文答辯，經校學位評定委員會審核，授予稅務碩士專業學位。