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植物保護一級學科是2005年批準設立的博士學位授予點，其中二級學科農藥學專業于1998年獲得碩士學位授予權。與國內同類學科比較，近年來在農藥分子設計、農藥合成化學、生物農藥與農藥生物化學等方面具有優勢和鮮明的研究特色。具體表現為：在國際上發表論文數（SCI）及其引用數居領先地位；科研成果獲獎數及其級別均居突出地位；科技成果轉化成績顯著；承擔的國家項目名列前茅；一批年輕學術帶頭人涌現, 其中一人獲得國家杰出青年基金，一人已受聘教育部長江學者特聘教授，一人獲得教育部跨世紀人才計劃資助，一名入選"百千萬"工程，一人獲得上海市科技精英稱號，三人獲得曙光計劃資助。

本專業現有教授11人，副教授7人。主要研究有：綠色化學農藥創制、基于受體結構的分子設計及定量構效關系研究、農藥品種及重要農藥中間體的開發、生物農藥研制及產業化開發、新型潛在高效殺菌劑的篩選、發現與應用、生物活性測試及毒理學研究。
　
一、培養目標

植物保護一級學科的碩士學位獲得者要熟悉本學科的發展現狀、方向以及國際學術研究前沿；掌握本學科基礎理論和專業知識；熟練運用電子計算機及先進儀器設備。具備嚴謹求實的科學態度，獨立從事與植物保護有關的工藝研究、毒理研究及新產品開發的能力；至少精通一門外國語，能熟練地閱讀本學科該語種的外文資料，并具有一定的應用該語種寫作的能力和進行國際學術交流能力；并具有較好的管理工作的能力。能勝任高等院校、科研院所、企業和其他單位的教學、科研和技術管理工作。

二、學制和學習年限

碩士生的學制為2．5年，學習年限不超過5年，課程學習學分有效期自研究生入學開始為5年。

三、研究方向

1． 農藥生物信息學
2． 農藥合成化學
3． 生物農藥
4． 昆蟲毒理學
5． 植物病害生物防治與微生物農藥
6． 殺菌劑毒理與應用

四、培養計劃

研究生應在入學后一個月內，在導師組及導師的指導下制定培養計劃，包括課程學習和學位論文工作計劃。學位論文工作包括研究方向，已有工作基礎，研究計劃和時間安排等。

五、課程設置

（一）總學分
本學科碩士生應完成不少于27學分的課程學習，一般在入學后的3個學習單元內完成。
提倡碩士生自主學習和研究型學習，提高創新能力。鼓勵碩士生在進行課程學習的同時，參與課題組的科學研究與學術活動，開展學位論文的前期工作。