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土壤學碩士學位授權點于2004年獲準招收土壤學專業研究生。經過5年的發展，已建立起一支業務素質高，科研能力強的導師隊伍。土壤學碩士點現有碩士生導師6人，其中教授4人，副教授2人，3人具有博士學位。目前已有22人畢業，在讀碩士研究生24人。

土壤學現已發展成為支撐云南省農業產業的重要應用基礎及應用學科，土壤學碩士點教師依托資源與環境學院土壤學實驗室、云南省環境科學與工程創新人才聯合培養基地、校農科基礎實驗教學中心等開展教學與科研工作。多年來，土壤學碩士點教師結合云南實際，在坡耕地水土保持技術與農業可持續發展，土壤物質循環與面源污染控制，土壤肥力與作物生產，重金屬污染土壤的修復、設施農業土壤改良、土壤微生物生態、土壤分類與評價、土地規劃與管理等方面做了大量的研究工作，為云南經濟社會發展培養了大批土壤學專門人才。累計獲省部級科技進步獎勵12項，在國內核心期刊上發表學術論文200余篇，主編和參編教材（專著）9部，目前承擔的科研項目包括國際合作、國家863項目、國家自然科學基金項目、教育部重點項目、云南省自然科學基金重點及面上項目、教育廳基金項目共20余項，在研經費300多萬元。

土壤學碩士點目前的招生方向有7個，分別為

（1）污染土壤修復；

（2）土壤肥力與作物生長；

（3）土壤分類與評價；

（4）設施農業土壤改良；

（5）土壤微生物生態；“

（6）土壤物質循環與面源污染控制；

（7）土地規劃與管理。