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生物化學與生物分子學碩士點于2003年由學校批準建設，2005年 11月由國家學位辦審查通過，2011年按生物學一級學科招生。在研的項目主要來源于國家自然基金，學術上形成了具有地學特色的研究方向，尤其是在生物地球化學、分子古生物學以及地微生物學等領域在國內已形成了學科優勢。

目前有教授3名，副教授1名，講師3名。包括國家杰出青年獲得者、學校特聘教授和國外的兼職教授等學科帶頭人。師資隊伍中有7人有國外留學經歷，并與有關大學保持著良好的合作。
實驗室的大型設備包括GC-MS、 GC- TIR-MS、MAT-251、Biolog微生物鑒定系統、G-Box凝膠成像系統、熒光定量PCR儀、梯度PCR儀、ICP-AES、Benckman高速離心機、Olympus顯微鏡等。借助古生物學與地層學碩士點和博士點，已培養5名畢業生，分別就業于上海、北京、廣州等地的高校、科研院所、科技館以及在國外繼續深造等。

學科的主要研究方向主要有分子生物學和地球微生物學。分子生物學主要包括①分子古生學，特色為應用現代分子生物學的手段，探索生物演化、起源；②現代微生物分子生物學的研究，通過分子生物學手段，檢測不同地質環境下出現的微生物類群，并探討微生物在地質過程中的作用。地球微生物學研究現代地質過程和地質環境下的微生物種類、群落特征以及微生物在各種地質過程中的作用，揭示微生物在生態系統中物質循環和能量流動的重要地位。