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中國科學院新疆天文臺始建于1957年，主要從事天體物理、射電天文技術、空間目標和碎片、應用天文等方面的觀測研究。在天體物理領域，主要從事脈沖星、恒星形成與演化、活動星系核和天體高能過程等研究；在射電天文技術領域，主要開展微波接收機、數字技術應用方面的研發工作；利用觀測條件的優勢，提供高質量的空間目標和碎片觀測服務；在應用天文方面，主要開展脈沖星計時陣以及導航應用研究，提供衛星導航地面站、GPS站的運行和觀測服務等。

新疆天文臺現有射電天文、光學天文與技術、應用天文三個研究室；下設五個特色研究團組、一個實驗室；有南山觀測基地、CAPS喀什地面站、GPS巴音布魯克站和GPS巴倫臺站等野外臺站；擁有25米射電望遠鏡觀測系統、中國區域定位系統、GPS衛星定時定位系統、太陽色球望遠鏡、40厘米精密光電觀測望遠鏡、1米口徑大視場天文望遠鏡、80厘米空間碎片觀測望遠鏡、空間目標觀測光電望遠鏡系統等多項大型儀器設備。

新疆天文臺率先建立了國內脈沖星觀測研究基地，是國內重要的厘米波分子譜線觀測研究基地，是中科院射電天文重點實驗室成員，是國家的一個重要天文學研究與實測基地、新技術創新基地、應用天文學研究和服務基地以及天文學高級人才培養基地；是國際甚長基線干涉測量（VLBI）網不可替代的臺站，是我國載人航天、探月工程和區域定位網等空間科學戰略發展中不可或缺的重要臺站，也是國際上能夠代表中國天文學科綜合實力的研究機構之一。在個研究領域均有實質性的國際合作計劃和項目，簽訂協議、備忘錄二十余項，參加了十余項國際合作計劃和四個國際合作組織，還承擔著國家繞月探測工程、火星探測—“螢火計劃”等重要科研任務。

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