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1930年國立青島大學（中國海洋大學前身）建校初期就設立了生物系，創建了動物學專業和植物學專業，建立了相應的教學實驗室，著名昆蟲學家曾省、水產學家林紹文、動物學家童第周、比較解剖生物學家劉咸、海洋生態學家朱樹屏、動物學家張璽、無脊椎動物學家高哲生、魚類學家鄒源琳、海洋生物學家曾呈奎、遺傳學家方宗熙、海藻學家鄭柏林、海洋生態學家李冠國、微生物學家王祖農、薛廷耀和海洋生物學家李嘉泳等曾先后在生物系執教，為我國培養了一大批知名的生物學家，如著名內分泌學家張致一、實驗胚胎學家莊孝僡、海水貝類養殖專家趙法箴院士、海水魚類養殖學家雷霽霖院士、海洋藥物學家管華詩院士等。1994年以海洋生物系為基礎組建了海洋生命學院，系統建設了動物學、植物學、生物化學、微生物學、動物生理學、遺傳學、組織胚胎學、生態學和藻類學9個教學實驗室。近80年的歷程，海洋生命科學的教學實驗室建設有了長足發展，老一輩著名海洋生物學家們的勤奮耕耘，為海洋生物學的學科發展奠定了堅實的學科基礎，在海洋生物學高水平人才培養、科技研發和產業化等諸多方面形成了獨特的優勢和學術積淀，為中心建設積累了寶貴的經驗和巨大的精神財富。

中國海洋大學作為山東省唯一獲得世界銀行貸款“高等教育發展”項目支持的教育部重點綜合性大學，早在1999年就以海洋生命學院原有的9個教學實驗室為基礎組建了基礎生物學實驗教學中心，并進行了重點建設，同年便在山東省“雙基”評估中被評為省級一類基礎實驗教學實驗室。2003年，中心被批準為省級生物基礎實驗教學示范中心建設單位；同年，學校又依托生命科學與技術學部和“國家生命科學與技術人才培養基地”，組建了由校、部兩級管理的多功能、開放性海洋生命科學實驗教學中心；2006年被批準為山東省海洋生命科學實驗教學示范中心。2007年被評為國家海洋生命科學實驗教學示范中心假設單位,2012年通過教育部組織的國家級實驗教學示范中心驗收.

中心實行校、院兩級管理的主任負責制。學校層面成立了專門的“實驗室工作委員會”和“實驗教學示范中心建設工作領導小組”，學校與學院聯合成立了“實驗室工作專家委員會”和“實驗教學示范中心建設工作小組”，直接領導、推進和監控中心的各項建設工作；中心主任采取固定與流動編制相結合的方式組建實驗隊伍，目前已建設了一支由專職人員和兼職實驗教師組成的高水平實驗教學隊伍。近年來，學校投入本中心的各類建設經費近2000萬元，設備年更新率高達71.4%，現有設備總值2133.28萬元，實驗室面積3190平方米，已具備完整的實驗教學體系、軟硬件實驗教學條件、高水平的實驗教學隊伍和科學的管理體制和運行機制。中心目前肩負著生命學部10個專業以及全校非生物科學類50余個專業1773名本科生生命科學通識課程的實驗教學任務，年接納學生的人時數為22.2萬小時。中心現已建設成為一個多功能、現代化、開放式的基礎性、綜合性和科研創新性的實驗教學基地，在實驗教學、師資隊伍、管理模式及設備與環境方面的條件不斷進行了完善。