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基本信息
姓名:劉智捷
出生年月:1984.12
性別:男
碩/博導：
民族:漢
開設課程：普通遺傳學；普通遺傳學實驗
職稱:講師
研究方向：玉米抗逆分子生物學
學位:理學博士

聯系方式辦公電話：18207192678
電子郵件：zhijie5.liu@gmail.com

個人簡介1.碩士期間參與了“逆境條件下玉米苗期根系miRNA的表達與調控機理研究”，利用小RNA芯片技術鑒定高鹽脅迫和低氧脅迫下誘導表達的miRNA，從中建立了miRNA與淹水、高鹽逆境的關系，并進一步對miRNA參與的逆境響應通路進行了推測和分析。相關研究成果分別在2008年[5]和2009年[6]均發表于AnnalsofBotany雜志上。
2.2008年以碩博連讀的培養方式轉入到博士期間的學習，并經鄭用璉教授推薦到美國冷泉港DoreenWare教授實驗室交流學習三年，期間主要進一步深入探討miRNA對漬水逆境的響應及其調控途徑。通過高通量測序技術對miRNA的表達量進行了深入的定量分析；利用qPCR對miRNA以及其下游靶基因的表達進行了進一步的確認；分析了miRNA基因啟動子區的順式作用元件，構建了miRNA介導的、玉米根系細胞響應短期漬害脅迫的基因表達調控網絡，闡述了miRNA在短期漬害逆境條件下參與的代謝及信號通路，并提出了miRNA介導的玉米根系細胞響應漬害的“節能假說”。相關研究成果以第一作者發表在PLoSOne雜志上[4]。
3.在冷泉港的三年期間，也參與了其他課題的研究工作：
1）參與了玉米基因組測序計劃，構建了部分測序文庫，為玉米B73全基因組測序提供了實驗材料和分析數據。相關工作于2009年作為封頁文章發表于Science雜志上[1]。
2）構建了5個玉米不同組織的小RNA文庫，用于高通量測序。學習并參與了后期的數據分析。研究結果于2009年發表于PLoSGenetics雜志上[3]。
3）參與了擬南芥轉錄因子文庫的構建工作中，共構建了由712轉錄因子所構成的轉錄因子文庫。利用這一文庫篩選了玉米以及擬南芥miRNA的啟動子，構建了miRNA的調控網絡。部分結果于2011年發表于NatureMethod雜志上[2]。
4.開展了玉米冠根中miRNA對長期淹水逆境脅迫響應的機理研究，參與了數據分析及論文的撰寫、修改。研究結果進一步證實了所提出的miRNA介導的漬害響應“節能假說”，并以并列第一作者身份于2012年發表于PhysiologiaPlantarum雜志上[7]。

科研項目

發明專利及獲獎情況

發表的論文及著作第一作者發表：
1.LiuZ,KumariS,ZhangL,ZhengY*,WareD*.CharacterizationofmiRNAsinresponsetoshort-termwaterlogginginthreeinbredlinesofZeamays.PLoSOne,2012;7(6):e39786.Epub2012Jun29.
2.ZhaiL,LiuZ,ZouX,JiangY,QiuF,ZhengY,ZhangZ*:Genome-wideIdentificationandAnalysisofMicroRNARespondingtoLong-TermwaterlogginginCrownRootsofMaizeSeedlings.PhysiologiaPlantarum,2012.doi:10.1111/j.1399-3054.2012.01653.x.（并列第一作者）

合作作者發表：
1.SchnablePS,WareD,FultonRS,SteinJC,WeiF,PasternakS,LiangC,ZhangJ,FultonL,GravesTA,MinxP,ReilyAD,CourtneyL,KruchowskiSS,TomlinsonC,StrongC,DelehauntyK,FronickC,CourtneyB,RockSM,BelterE,DuF,KimK,AbbottRM,CottonM,LevyA,MarchettoP,OchoaK,JacksonSM,GillamB,ChenW,YanL,HigginbothamJ,CardenasM,WaligorskiJ,ApplebaumE,PhelpsL,FalconeJ,KanchiK,ThaneT,ScimoneA,ThaneN,HenkeJ,WangT,RuppertJ,ShahN,RotterK,HodgesJ,IngenthronE,CordesM,KohlbergS,SgroJ,DelgadoB,MeadK,ChinwallaA,LeonardS,CrouseK,ColluraK,KudrnaD,CurrieJ,HeR,AngelovaA,RajasekarS,MuellerT,LomeliR,ScaraG,KoA,DelaneyK,WissotskiM,LopezG,CamposD,BraidottiM,AshleyE,GolserW,KimH,LeeS,LinJ,DujmicZ,KimW,TalagJ,ZuccoloA,FanC,SebastianA,KramerM,SpiegelL,NascimentoL,ZutavernT,MillerB,AmbroiseC,MullerS,SpoonerW,NarechaniaA,RenL,WeiS,KumariS,FagaB,LevyMJ,McMahanL,VanBurenP,VaughnMW,YingK,YehCT,EmrichSJ,JiaY,KalyanaramanA,HsiaAP,BarbazukWB,BaucomRS,BrutnellTP,CarpitaNC,ChaparroC,ChiaJM,DeragonJM,EstillJC,FuY,JeddelohJA,HanY,LeeH,LiP,LischDR,LiuS,LiuZ,NagelDH,McCannMC,SanMiguelP,MyersAM,NettletonD,NguyenJ,PenningBW,PonnalaL,SchneiderKL,SchwartzDC,SharmaA,SoderlundC,SpringerNM,SunQ,WangH,WatermanM,WestermanR,WolfgruberTK,YangL,YuY,ZhangL,ZhouS,ZhuQ,BennetzenJL,DaweRK,JiangJ,JiangN,PrestingGG,WesslerSR,AluruS,MartienssenRA,CliftonSW,McCombieWR,WingRA,WilsonRK*:TheB73maizegenome:complexity,diversity,anddynamics.Science326(5956):1112-1115,2009.
2.GaudinierA,ZhangL,Reece-HoyesJS,Taylor-TeeplesM,PuL,LiuZ,BretonG,Pruneda-PazJL,KimD,KaySA,WalhoutAJM,WareD,BradySM.EnhancedY1HassaysforArabidopsis.Naturemethods,2011.8:1053-1055.
3.ZhangL,ChiaJM,KumariS,SteinJC,LiuZ,NarechaniaA,MaherCA,GuillK,McMullenMD,WareD*:Agenome-widecharacterizationofmicroRNAgenesinmaize.PLoSGenet5(11):e1000716,2009.
4.ZhangZ,WeiL,ZouX,TaoY,LiuZ,ZhengY*:Submergence-responsiveMicroRNAsarepotentiallyinvolvedintheregulationofmorphologicalandmetabolicadaptationsinmaizerootcells.AnnBot102(4):509-519,2008.被引用次數：37.IF(2008):3.501
5.DingD,ZhangL,WangH,LiuZ,ZhangZ,ZhengY*:DifferentialexpressionofmiRNAsinresponsetosaltstressinmaizeroots.AnnBot103(1):29-38,2009.